все параметры
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Источник: ncbi-blast+  ]

Пакет: ncbi-blast+ (2.8.1-1)

Ссылки для ncbi-blast+

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код ncbi-blast+:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

поиск первичных биологических последовательностей

Популярная программа для поиска гомологичных последовательностей. Есть варианты BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), которые сравнивают нуклеотидные последовательности с базой данных секвенированных нуклеиновых кислот и их участков, есть, которые сравнивают аминокислотные последовательности белка с имеющейся базой данных белков и их участков, а также есть варианты способные транслировать нуклеотидные последовательности в аминокислотные и потом выполнять поиск по соответствующим базам. PSI-BLAST создаёт PSSM (Position Specific Scoring Matrix) при поиске белковых гомологов и использует её для дальнейших поисков. Можно также выполнять поиск белков и нуклеотидов по базе данных PSSM. NCBI поддерживает веб-страницу BLAST по адресу blast.ncbi.nlm.nih.gov, а также сетевой сервис поиска известных последовательностей.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: use::analysing, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к ncbi-blast+

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка ncbi-blast+

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 10 616,8 Кб46 520,0 Кб [список файлов]
arm64 9 324,5 Кб43 506,0 Кб [список файлов]
armel 8 644,8 Кб36 484,0 Кб [список файлов]
armhf 8 892,3 Кб30 236,0 Кб [список файлов]
i386 11 425,6 Кб45 816,0 Кб [список файлов]
mips 7 695,5 Кб50 249,0 Кб [список файлов]
mips64el 7 820,2 Кб51 236,0 Кб [список файлов]
mipsel 7 882,7 Кб50 185,0 Кб [список файлов]
ppc64el 10 576,4 Кб56 198,0 Кб [список файлов]
s390x 9 303,6 Кб46 126,0 Кб [список файлов]