Пакет: phast (1.4+dfsg-1)

[ Источник: phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Другие пакеты, относящиеся к phast

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.23)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libpcre3

  устаревшая библиотека поддержки регулярных выражений, совместимых с Perl5 — файлы времени исполнения

• dep: libtmglib3

  test matrix generators of LAPACK - shared version

Загрузка phast

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
i386	2 246,3 Кб	30 268,0 Кб	[список файлов]