Пакет: abyss (2.1.5-7)

[ Источник: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к abyss

• dep: bsdmainutils

  набор утилит из FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.28)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  динамически подключаемая библиотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: make

  утилита управления компиляцией

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

Загрузка abyss

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
i386	2 960,8 Кб	9 334,0 Кб	[список файлов]