Пакет: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Источник: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Другие пакеты, относящиеся к sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Загрузка sniffles

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	703,3 Кб	1 100,0 Кб	[список файлов]
arm64	681,9 Кб	1 040,0 Кб	[список файлов]
armel	674,2 Кб	1 027,0 Кб	[список файлов]
armhf	680,5 Кб	899,0 Кб	[список файлов]
i386	717,0 Кб	1 127,0 Кб	[список файлов]
mips64el	680,8 Кб	1 166,0 Кб	[список файлов]
mipsel	682,9 Кб	1 147,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	707,2 Кб	1 196,0 Кб	[список файлов]
s390x	679,3 Кб	1 100,0 Кб	[список файлов]