Пакет: skewer (0.2.2-2)

[ Источник: skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Другие пакеты, относящиеся к skewer

• dep: libc6 (>= 2.17)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка skewer

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	68,2 Кб	198,0 Кб	[список файлов]
arm64	59,4 Кб	166,0 Кб	[список файлов]
armel	58,8 Кб	174,0 Кб	[список файлов]
armhf	60,4 Кб	130,0 Кб	[список файлов]
i386	71,0 Кб	214,0 Кб	[список файлов]
mips64el	63,4 Кб	212,0 Кб	[список файлов]
mipsel	65,1 Кб	206,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	65,9 Кб	211,0 Кб	[список файлов]
s390x	60,9 Кб	194,0 Кб	[список файлов]