Пакет: kma (1.3.10-1)

[ Источник: kma  ]

mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

Другие пакеты, относящиеся к kma

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка kma

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	179,4 Кб	487,0 Кб	[список файлов]
arm64	168,7 Кб	487,0 Кб	[список файлов]
armel	123,1 Кб	344,0 Кб	[список файлов]
armhf	124,2 Кб	240,0 Кб	[список файлов]
i386	143,9 Кб	404,0 Кб	[список файлов]
mips64el	174,6 Кб	586,0 Кб	[список файлов]
mipsel	126,3 Кб	380,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	195,7 Кб	731,0 Кб	[список файлов]
s390x	169,0 Кб	535,0 Кб	[список файлов]