Пакет: kleborate-examples (2.0.1-1)

[ Источник: kleborate  ]

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Другие пакеты, относящиеся к kleborate-examples

• rec: kleborate

  tool to screen Klebsiella genome assemblies

Загрузка kleborate-examples

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	5 851,7 Кб	5 861,0 Кб	[список файлов]