все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: gmap  ]

Пакет: gmap (2021-02-22+ds-1)

Ссылки для gmap

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код gmap:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).
GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Теги: Область: Биология, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к gmap

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка gmap

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 11 332,0 Кб86 543,0 Кб [список файлов]
arm64 6 976,6 Кб57 915,0 Кб [список файлов]
armel 5 605,3 Кб43 621,0 Кб [список файлов]
armhf 5 756,4 Кб41 853,0 Кб [список файлов]
i386 5 907,0 Кб43 773,0 Кб [список файлов]
mips64el 5 324,5 Кб54 666,0 Кб [список файлов]
mipsel 5 291,6 Кб45 235,0 Кб [список файлов]
ppc64el 7 219,0 Кб60 727,0 Кб [список файлов]