Пакет: edlib-aligner (1.2.6-1)

[ Источник: libedlib  ]

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Другие пакеты, относящиеся к edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libedlib0 (= 1.2.6-1)

  library for sequence alignment using edit distance

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка edlib-aligner

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	22,3 Кб	65,0 Кб	[список файлов]
arm64	21,3 Кб	57,0 Кб	[список файлов]
armel	19,0 Кб	52,0 Кб	[список файлов]
armhf	19,0 Кб	48,0 Кб	[список файлов]
i386	22,3 Кб	64,0 Кб	[список файлов]
mips64el	21,2 Кб	62,0 Кб	[список файлов]
mipsel	21,7 Кб	61,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	25,5 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
s390x	20,9 Кб	61,0 Кб	[список файлов]