Пакет: bitseq (0.7.5+dfsg-5)

[ Источник: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Другие пакеты, относящиеся к bitseq

• dep: libc6 (>= 2.23)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  Пакет недоступен

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, mips64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка bitseq

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	339,9 Кб	1 875,0 Кб	[список файлов]
arm64	299,7 Кб	1 651,0 Кб	[список файлов]
armel	282,5 Кб	1 522,0 Кб	[список файлов]
armhf	288,6 Кб	1 106,0 Кб	[список файлов]
i386	358,3 Кб	1 906,0 Кб	[список файлов]
mips64el	329,5 Кб	2 194,0 Кб	[список файлов]
mipsel	330,5 Кб	2 052,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	339,9 Кб	2 407,0 Кб	[список файлов]
s390x	299,3 Кб	1 887,0 Кб	[список файлов]