все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: python-pyfaidx  ]

Пакет: python3-pyfaidx (0.5.9.2-1)

Ссылки для python3-pyfaidx

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код python-pyfaidx:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

Другие пакеты, относящиеся к python3-pyfaidx

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка python3-pyfaidx

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 25,8 Кб119,0 Кб [список файлов]