Пакет: r-bioc-titancna (1.28.0-2)

[ Источник: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-titancna

• dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, mipsel, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf]

• dep: r-api-4.0

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.6)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.8.7)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.24.3)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.6.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.18.7)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R foreach looping support

Загрузка r-bioc-titancna

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3 858,4 Кб	7 619,0 Кб	[список файлов]
arm64	3 857,4 Кб	7 615,0 Кб	[список файлов]
armel	3 858,9 Кб	7 614,0 Кб	[список файлов]
armhf	3 857,2 Кб	7 610,0 Кб	[список файлов]
i386	3 858,2 Кб	7 614,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3 857,0 Кб	7 616,0 Кб	[список файлов]
mipsel	3 857,1 Кб	7 615,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3 858,7 Кб	7 663,0 Кб	[список файлов]
s390x	3 857,0 Кб	7 615,0 Кб	[список файлов]