Пакет: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

[ Источник: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Другие пакеты, относящиеся к nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [не arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  поиск первичных биологических последовательностей

Загрузка nast-ier

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	21,0 Кб	101,0 Кб	[список файлов]
arm64	20,7 Кб	96,0 Кб	[список файлов]
armel	20,3 Кб	96,0 Кб	[список файлов]
armhf	20,1 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
i386	21,3 Кб	100,0 Кб	[список файлов]
mips64el	21,4 Кб	102,0 Кб	[список файлов]
mipsel	21,2 Кб	97,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	21,9 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
s390x	20,9 Кб	100,0 Кб	[список файлов]