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Package: mipe (1.1-3)

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ferramentas para guardar dados derivados de PCR

MIPE disponibiliza um formato standard para intercâmbio e/ou armazenagem de toda a informação associada com experiências de PCR usando um ficheiro de texto simples. Isto irá:

 * permitir o intercâmbio de dados PCR entre pesquisadores/laboratórios
 * permitir a rastreabilidade dos dados
 * prevenir problemas ao submeter dados para dbSTS ou dbSNP
 * habilitar a escrita de scripts standard para extrair dados (ex. uma
   lista de primários PCR, posições SNP ou haplótipos para diferentes
   animais)

Embora esta ferramenta possa ser usada para armazenamento de dados, o seu principal objectivo deve ser o intercâmbio de dados. Para grandes repositórios, as bases de dados relacionais são mais apropriadas para o armazenamento destes dados. O formato MIPE pode então ser usado como um formato standard para importar e/ou exportar destas bases de dados.

MIPE foi publicado em: Aerts J & Veenendaal T. MIPE - a XML-format to facilitate the storage and exchange of PCR-related data. Online Journal of Bioinformatics 6(2): 114-120 (2005).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Molecular Biology, Implemented in: Perl, User Interface: Command Line, Role: Documentation, Program, Scope: Utility, Purpose: Data Organisation, Supports Format: XML

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