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Reconstrução de árvores filogenéticas por máxima parecença

TREE-PUZZLE (o novo nome para PUZZLE) é um programa de consola interactivo que implementa um algoritmo rápido de pesquisa de árvore, intrigante em quarteto, que permite a análise de grandes conjuntos de dados e atribui automaticamente estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE também computa distâncias pareadas de máxima parecença assim como o alcance de ramificações para árvores especificadas pelo utilizador. O alcance das ramificações também pode ser calculado sub a assumpção de relógio. Adicionalmente, TREE-PUZZLE oferece um método inovador de mapeamento de parecenças, para investigar o suporte de um ramo interno hipotético sem computar uma árvore inteira e para visualizar o conteúdo filogenético de uma sequência de alinhamento.

Este é o pacote de documentação para o tree-puzzle.

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