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Package: garlic (1.6-1.1)

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um programa de visualização para biomoléculas

Garlic é escrito para a investigação de proteínas de membrana. Ele pode ser usado para visualizar outras proteínas, bem como alguns objetos geométricos. Esta versão do garlic reconhece o formato PDB versão 2.1. O garlic também pode ser usado para analisar seqüências de proteínas.

Ele só depende das bibliotecas X, nenhuma outra biblioteca é necessária.

Recursos incluem:

 - A posição e a espessura do 'slab' são visíveis numa pequena janela.
 - Ligações atômicas bem como átomos são tratados como objetos desenháveis
   independentemente.
 - As cores dos átomos e das ligações dependem da posição. Cinco modos de
   mapeamento estão disponíveis ().
 - Capaz de exibir imagem estéreo.
 - Capaz de exibir outros objetos geométricos, como a membrana.
 - Informação atômica é disponibilizada quando você passa o mouse sobre
   um átomo. Não é necessário clicar, basta mover o ponteiro do mouse
   sobre a estrutura!
 - Capaz de carregar mais de uma estrutura.
 - Capaz de desenhar gráfico de Ramachandran, diagrama de Venn,
 - Capaz de desenhar 'Ramachandran plot', helicóide, diagrama de Venn,
   'averaged hydrophobicity and hydrophobic moment plot'.
 - A linha de comando está disponível no rodapé da janela principal.
   Ela é capaz de exibir uma mensagem de erro e uma seqüência de comando.

Tags: Field: Biology, Chemistry, User Interface: X Window System, Role: role::program, scope::utility, Interface Toolkit: X library, Purpose: Data Visualization, X Window System: Application

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