Pacote: libbio-samtools-perl (1.43-5 e outros)

[ Fonte: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Etiquetas: Desenvolvimento de software: Desenvolvimento Perl, Bibliotecas, Implementado em: implemented-in::c, implemented-in::perl, Função: Biblioteca de desenvolvimento, Biblioteca compartilhada

Outros pacotes relacionados a libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

• dep: perlapi-5.40.0

  pacote virtual fornecido por perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de libbio-samtools-perl

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1.43-5+b1	177.2 kB	587.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.43-5+b1	166.2 kB	615.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.43-5+b1	162.1 kB	549.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.43-5+b1	161.3 kB	449.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.43-5+b1	187.4 kB	621.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.43-5+b1	184.7 kB	743.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.43-5+b1	179.4 kB	527.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.43-5+b1	171.4 kB	607.0 kB	[lista de arquivos]