[ buster ]
Pacote-fonte: tophat (2.1.1+dfsg1-2)
Links para tophat
Recursos de Debian:
- Relatórios de bug
- Informação de desenvolvedor(a)
- Debian Changelog
- Arquivo de copyright
- Repositório-fonte Debian (Git)
- Rastreador de patch Debian
Mantenedores(as):
- Debian Med Packaging Team (QA Página, E-mail Arquivo)
- Carlos Borroto (QA Página)
- Alexandre Mestiashvili (QA Página)
- Andreas Tille (QA Página)
Fontes externas:
- Pagina principal [ccb.jhu.edu]
Os seguintes pacotes binários são criados a partir deste pacote-fonte:
- tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
Outros pacotes relacionados a tophat
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- adep: debhelper (>= 11~)
- programas de auxílio para debian/rules
-
- adep: libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
-
- adep: zlib1g-dev
- biblioteca de compressão - desenvolvimento
-
- adep: python
- linguagem interativa de alto nível orientada a objetos (versão Python2)
-
- adep: seqan-dev (>= 1.4)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
-
- adep: libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
-
- adep: help2man
- Gerador automático de páginas de manual.
-
- adep: bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
Download tophat
| Arquivo | Tamanho (em kB) | Soma de verificação MD5 |
|---|---|---|
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.dsc | 2.1 kB | 679aac3888efdaae6fc233c73891040b |
| tophat_2.1.1+dfsg1.orig.tar.xz | 341.8 kB | 9e350c80adba6b6fdc8045ef4e085800 |
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.debian.tar.xz | 18.2 kB | 5072d66e095477f87ce398ccfd02098f |
- Repositório-fonte de pacotes Debian (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat.git
- Repositório-fonte de pacotes Debian (navegável)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat