Pacote: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-12 e outros)

[ Fonte: tree-puzzle  ]

reconstrução paralelizada de árvores filogenéticas por máxima probabilidade

TREE-PUZZLE (o novo nome para o PUZZLE) é um programa interativo para console que implementa um algoritmo de procura rápida em árvore, "quartet puzzling", que permite análise de grandes conjuntos de dados e automaticamente atribui estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE oferece um método novo, com mapeamento por estimativa, para investigar o suporte a um ramo interno hipotético sem computar uma árvore completa e visualizar o conteúdo filogenético de um alinhamento de seqüência.

Esta é a versão paralelizada do tree-puzzle.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, use::comparing, Suporta o formato: Texto puro, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Pacote não disponível

Download de tree-ppuzzle

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
s390x	5.3~rc16+dfsg-12+b1	196.9 kB	492.0 kB	[lista de arquivos]