Pacote: python3-unifrac (1.3-4 e outros)

[ Fonte: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Outros pacotes relacionados a python3-unifrac

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• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

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  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

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• dep: libssu0 (>= 0.10.0) [alpha]

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

  dep: libssu0 (>= 1.1.1) [m68k]

  dep: libssu0 (>= 1.4) [não alpha, m68k]

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• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.11) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.12) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.14) [não alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.10~) [alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.13~) [não alpha, m68k]

• dep: python3-biom-format

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• dep: python3-numpy

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• dep: python3-numpy2-abi0 [não alpha, m68k]

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• dep: python3-skbio [alpha, m68k]

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

  dep: python3-skbio (>= 0.6.1) [não alpha, m68k]

Download de python3-unifrac

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.10.0-3	106.4 kB	582.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.3-4+b4	147.4 kB	722.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.3-4+b3	132.6 kB	685.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.3-4+b3	142.2 kB	749.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.1.1-2	135.9 kB	715.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.3-4+b3	128.8 kB	758.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.3-4+b3	144.7 kB	813.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.3-4+b3	145.4 kB	649.0 kB	[lista de arquivos]