Pacote: python3-mappy (2.27+dfsg-1 e outros) [debports]

[ Fonte:  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Outros pacotes relacionados a python3-mappy

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão python3 padrão)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de python3-mappy

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.27+dfsg-1+b3	198.4 kB	958.0 kB	[lista de arquivos]