Pacote: tombo (1.5.1-2 e outros)

[ Fonte: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Outros pacotes relacionados a tombo

• dep: cython3

  extensões-C para Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão padrão da python3)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  pacote de descoberta e acesso a recursos utilizando o pkg_resources

• dep: python3-scipy

  ferramentas científicas para Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
  também um pacote virtual fornecido por python3-rpy2

Download de tombo

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1.5.1-2+b2	421.8 kB	1,424.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.5.1-2+b2	410.8 kB	1,395.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.5.1-2+b2	412.9 kB	1,324.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.5.1-2+b2	423.4 kB	1,440.0 kB	[lista de arquivos]