Pacote: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

[ Fonte: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Outros pacotes relacionados a covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de covtobed

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	44.8 kB	137.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	39.7 kB	121.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	41.8 kB	92.0 kB	[lista de arquivos]
i386	48.5 kB	144.0 kB	[lista de arquivos]