Pacote: python3-pairtools (0.3.0-2 e outros)

[ Fonte: pairtools  ]

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Outros pacotes relacionados a python3-pairtools

• dep: cython3

  extensões-C para Python 3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [não amd64, arm64, ppc64el]

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão padrão da python3)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-nose

  test discovery and running for Python3 unittest

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

Download de python3-pairtools

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0.3.0-2+b2	121.3 kB	440.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.3.0-2+b2	110.5 kB	407.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.3.0-2+b2	109.3 kB	394.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.3.0-2+b2	109.4 kB	342.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.3.0-2+b2	119.7 kB	426.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.3.0-2+b2	108.1 kB	437.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	0.3.0-2+b2	108.0 kB	414.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.3.0-2+b2	120.3 kB	479.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.3.0-2+b2	107.5 kB	415.0 kB	[lista de arquivos]