wszystkie opcje
wheezy  ] [  jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: bowtie  ]

Pakiet: bowtie (0.12.7-3)

Odnośniki dla bowtie

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bowtie:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Zaimplementowane w: C++, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bowtie

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie bowtie

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
armel 1 263,6 KiB2 763,0 KiB [lista plików]