Pakiet: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-9)

[ Pakiet źródłowy: tree-puzzle  ]

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Pakiet niedostępny

Pobieranie tree-puzzle

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	167,7 KiB	405,0 KiB	[lista plików]
arm64	155,3 KiB	380,0 KiB	[lista plików]
armel	160,0 KiB	408,0 KiB	[lista plików]
armhf	151,1 KiB	300,0 KiB	[lista plików]
i386	178,5 KiB	484,0 KiB	[lista plików]
mips64el	166,7 KiB	468,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	176,1 KiB	493,0 KiB	[lista plików]
s390x	153,9 KiB	408,0 KiB	[lista plików]