Pakiet: python3-pdb2pqr (3.6.1+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: pdb2pqr  ]

Przygotowywanie struktur białek do obliczeń elektrostatycznych

PDB2PQR to pakiet oprogramowania w języku Python, który automatyzuje wiele typowych zadań związanych z przygotowywaniem konstrukcji do obliczeń elektrostatyki ciągłej. W ten sposób zapewnia niezależne od platformy narzędzie do konwersji plików białek w formacie PDB do formatu PQR. Zadania te obejmują:

 * Dodawanie ograniczonej liczby brakujących ciężkich atomów do
   struktur biomolekularnych.
 * Określanie pKa łańcuchów bocznych.
 * Umieszczanie brakujących atomów wodoru.
 * Optymalizację białka pod kątem korzystnych wiązań wodorowych.
 * Przypisywanie parametrów ładunku i promienia z różnych pól
   siłowych.

Inne pakiety związane z python3-pdb2pqr

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-docutils

  text processing system for reStructuredText (implemented in Python 3)

• dep: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• dep: python3-pdbx

  utilities for PDBx/mmCIF storage model (Python 3)

• dep: python3-propka

  heuristic pKa calculations with ligands (Python 3)

• dep: python3-requests

  Elegancka i prosta biblioteka HTTP dla Pythona 3, zbudowana dla ludzi

Pobieranie python3-pdb2pqr

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	132,6 KiB	1 142,0 KiB	[lista plików]