wszystkie opcje
buster  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: voronota  ]

Pakiet: voronota (1.18.1877-2)

Odnośniki dla voronota

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego voronota:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

Inne pakiety związane z voronota

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie voronota

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 793,7 KiB4 093,0 KiB [lista plików]
amd64 808,7 KiB3 829,0 KiB [lista plików]
arm64 755,5 KiB3 597,0 KiB [lista plików]
armel 720,8 KiB3 540,0 KiB [lista plików]
armhf 728,9 KiB3 092,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 796,5 KiB3 716,0 KiB [lista plików]
hurd-i386 851,3 KiB3 936,0 KiB [lista plików]
i386 850,3 KiB3 932,0 KiB [lista plików]
kfreebsd-amd64 805,4 KiB3 825,0 KiB [lista plików]
kfreebsd-i386 849,2 KiB3 932,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 661,9 KiB3 523,0 KiB [lista plików]
mips 749,9 KiB4 073,0 KiB [lista plików]
mips64el 742,1 KiB4 128,0 KiB [lista plików]
mipsel 761,6 KiB4 077,0 KiB [lista plików]
powerpcspe (port nieoficjalny) 760,5 KiB3 716,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 793,4 KiB3 975,0 KiB [lista plików]
ppc64el 795,8 KiB3 909,0 KiB [lista plików]
s390x 738,9 KiB3 749,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 888,5 KiB3 555,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 712,4 KiB3 649,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 804,5 KiB3 772,0 KiB [lista plików]