wszystkie opcje
buster  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: voronota  ]

Pakiet: voronota (1.19.2352-1)

Odnośniki dla voronota

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego voronota:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

Inne pakiety związane z voronota

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie voronota

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 1 668,6 KiB10 345,0 KiB [lista plików]
amd64 1 669,9 KiB9 916,0 KiB [lista plików]
arm64 1 592,5 KiB9 632,0 KiB [lista plików]
armel 1 565,5 KiB9 575,0 KiB [lista plików]
armhf 1 582,9 KiB9 043,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 1 658,7 KiB9 841,0 KiB [lista plików]
hurd-i386 1 741,1 KiB10 131,0 KiB [lista plików]
i386 1 740,9 KiB10 111,0 KiB [lista plików]
kfreebsd-amd64 1 664,0 KiB9 908,0 KiB [lista plików]
kfreebsd-i386 1 741,7 KiB10 123,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 1 533,1 KiB9 750,0 KiB [lista plików]
mips 1 607,5 KiB10 385,0 KiB [lista plików]
mips64el 1 589,3 KiB10 479,0 KiB [lista plików]
mipsel 1 620,4 KiB10 394,0 KiB [lista plików]
powerpcspe (port nieoficjalny) 1 616,8 KiB9 815,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 1 679,9 KiB10 266,0 KiB [lista plików]
ppc64el 1 677,0 KiB10 136,0 KiB [lista plików]
s390x 1 588,8 KiB9 876,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 1 757,6 KiB9 602,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 1 551,6 KiB9 741,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 1 653,3 KiB9 751,0 KiB [lista plików]