Pakiet: tophat-recondition (1.4-3)

Odnośniki dla tophat-recondition

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego tophat-recondition:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

post-processor for TopHat unmapped reads

tophat-recondition is a post-processor for TopHat unmapped reads (contained in unmapped.bam), making them compatible with downstream tools (e.g., the Picard suite, samtools, GATK) (TopHat issue #17). It also works around bugs in TopHat:

 * the "mate is unmapped" SAM flag is not set on any reads in the
   unmapped.bam file (TopHat issue #3)
 * the mapped mate of an unmapped read can be absent from
   accepted_hits.bam, creating a mismatch between the file and the unmapped
   read's flags (TopHat issue #16)

Inne pakiety związane z tophat-recondition

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

sug: tophat2

Pakiet niedostępny

Pobieranie tophat-recondition

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	10,9 KiB	36,0 KiB	[lista plików]