Pakiet: tm-align (20190822+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: tm-align  ]

Strukturalne dopasowywanie białek

TM-align to algorytm komputerowy, służący do dopasowywania struktury białek przy użyciu programowania dynamicznego. Punktacja przeprowadzana jest za pomocą rotacji macierzy TM-score. Przypomina to RMSD, ponieważ niewyrównane części struktury wpływają na punktację w mniejszym stopniu niż regiony bardziej konserwatywne strukturalnie.

Znaczniki: Rola: Program

Inne pakiety związane z tm-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.29) [ia64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4, sparc64]

  Pakiet niedostępny

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [ia64]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• sug: pymol

  Molekularny system graficzny

• sug: rasmol

  visualization of biological macromolecules

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie tm-align

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	861,6 KiB	1 371,0 KiB	[lista plików]
amd64	20190822+dfsg-2	844,6 KiB	1 342,0 KiB	[lista plików]
arm64	20190822+dfsg-2	845,4 KiB	1 322,0 KiB	[lista plików]
armel	20190822+dfsg-2	851,4 KiB	1 349,0 KiB	[lista plików]
armhf	20190822+dfsg-2	848,0 KiB	1 301,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	855,4 KiB	1 338,0 KiB	[lista plików]
i386	20190822+dfsg-2	844,3 KiB	1 345,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	869,5 KiB	1 507,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	843,0 KiB	1 368,0 KiB	[lista plików]
mips64el	20190822+dfsg-2	850,3 KiB	1 350,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	849,7 KiB	1 394,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	20190822+dfsg-2	850,4 KiB	1 394,0 KiB	[lista plików]
riscv64	20190822+dfsg-2+b1	855,0 KiB	1 325,0 KiB	[lista plików]
s390x	20190822+dfsg-2	842,2 KiB	1 334,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	866,0 KiB	1 325,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	852,1 KiB	1 364,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	20190822+dfsg-2	845,1 KiB	1 341,0 KiB	[lista plików]