Pakiet: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Inne pakiety związane z sprai

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: time

  Program GNU time do pomiaru wykorzystania zasobów procesora

• sug: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• sug: pbalign

  Pakiet niedostępny

• sug: pbgenomicconsensus

  Pakiet niedostępny

• sug: pbh5tools

  Pakiet niedostępny

Pobieranie sprai

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 477,6 KiB	1 714,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-2	1 475,9 KiB	1 706,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-2	1 473,9 KiB	1 694,0 KiB	[lista plików]
armel	0.9.9.23+dfsg1-2	1 473,3 KiB	1 686,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-2	1 471,6 KiB	1 666,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 475,2 KiB	1 694,0 KiB	[lista plików]
i386	0.9.9.23+dfsg1-2	1 477,0 KiB	1 710,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 485,0 KiB	1 738,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 470,4 KiB	1 686,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-2	1 476,7 KiB	1 705,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 477,3 KiB	1 882,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-2	1 477,6 KiB	1 882,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-2+b1	1 474,3 KiB	1 690,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-2	1 473,9 KiB	1 698,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 475,1 KiB	1 678,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 473,7 KiB	1 717,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 474,9 KiB	1 702,0 KiB	[lista plików]