Pakiet: travis (220729-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: travis  ]

trajectory analyzer and visualizer

TRAVIS (Trajectory Analyzer and Visualizer) is a free tool for analyzing and visualizing trajectories from all kinds of Molecular Dynamics or Monte Carlo simulations. The aim of TRAVIS is to collect as many analyses as possible in one program, creating a powerful tool and making it unnecessary to use many different programs for evaluating simulations. This should greatly rationalize and simplify the workflow of analyzing trajectories. The following analysis functions are available:

Static (time independent) Functions:

 * Radial, Angular, Dihedreal or Combined Distribution Function
 * Point-Plane or Point-Line Distance Distribution
 * Plane Projection Distribution
 * Fixed Plane Density Profile
 * Density, Spatial or Dipole Distribution Function

Dynamic (time dependent) Functions:

 * Velocity Distribution Function
 * Mean Square Displacement / Diffusion Coefficients
 * Velocity Autocorrelation Functions
 * Vector Reorientation Dynamics
 * Van Hove Correlation Function
 * Aggregation Functions (DACF, DLDF, DDisp)

Spectroscopic Functions:

 * Calculate Power Spectrum
 * Calculate IR Spectrum
 * Calculate Raman Spectrum

TRAVIS can read trajectory files in XYZ, PDB, LAMMPS or DLPOLY format.

Inne pakiety związane z travis

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• sug: cp2k

  Ab Initio Molecular Dynamics

• sug: gnuplot

  Interaktywny program do tworzenia wykresów, sterowany z wiersza poleceń
  również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• sug: grace

  Narzędzie do wykreślania i sporządzania wykresów XY

• sug: graphviz

  rich set of graph drawing tools

• sug: pymol

  Molekularny system graficzny

Pobieranie travis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	220729-1	1 527,1 KiB	5 617,0 KiB	[lista plików]
amd64	220729-1	1 637,5 KiB	4 686,0 KiB	[lista plików]
arm64	220729-1	1 373,9 KiB	4 270,0 KiB	[lista plików]
armel	220729-1	1 489,3 KiB	4 781,0 KiB	[lista plików]
armhf	220729-1	1 434,2 KiB	3 373,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	220729-1	1 494,9 KiB	4 610,0 KiB	[lista plików]
i386	220729-1	1 670,8 KiB	5 085,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	220729-1	1 921,2 KiB	10 254,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	220729-1	1 512,7 KiB	4 965,0 KiB	[lista plików]
mips64el	220729-1	1 411,2 KiB	5 514,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	220729-1	1 539,5 KiB	5 550,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	220729-1	1 560,9 KiB	5 294,0 KiB	[lista plików]
riscv64	220729-1+b1	1 587,5 KiB	3 859,0 KiB	[lista plików]
s390x	220729-1	1 414,8 KiB	4 638,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	220729-1	1 942,9 KiB	4 719,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	220729-1	1 343,3 KiB	5 236,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	220729-1	1 626,3 KiB	4 557,0 KiB	[lista plików]