Pakiet: tantan (49-2)

[ Pakiet źródłowy: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z tantan

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Pobieranie tantan

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	39,0 KiB	145,0 KiB	[lista plików]
amd64	41,1 KiB	120,0 KiB	[lista plików]
arm64	37,1 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
armel	36,9 KiB	103,0 KiB	[lista plików]
armhf	34,8 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	39,5 KiB	105,0 KiB	[lista plików]
i386	43,5 KiB	119,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	51,1 KiB	200,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	38,2 KiB	111,0 KiB	[lista plików]
mips64el	41,1 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	44,0 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	44,0 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
riscv64	40,6 KiB	92,0 KiB	[lista plików]
s390x	44,2 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	47,7 KiB	143,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	34,6 KiB	1 042,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	41,1 KiB	115,0 KiB	[lista plików]