Pakiet: tandem-mass (1:201702011-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: tandem-mass  ]

mass spectrometry software for protein identification

X! Tandem can match tandem mass spectra with peptide sequences, in a process that is commonly used to perform protein identification.

This software has a very simple, unsophisticated application programming interface (API): it simply takes an XML file of instructions on its command line, and outputs the results into an XML file, which has been specified in the input XML file. The output file format is described at http://www.thegpm.org/docs/X_series_output_form.pdf.

Unlike some earlier generation search engines, all of the X! Series search engines calculate statistical confidence (expectation values) for all of the individual spectrum-to-sequence assignments. They also reassemble all of the peptide assignments in a data set onto the known protein sequences and assign the statistical confidence that this assembly and alignment is non-random. The formula for which can be found here. Therefore, separate assembly and statistical analysis software, e.g. PeptideProphet and ProteinProphet, do not need to be used.

Inne pakiety związane z tandem-mass

• dep: libc6 (>= 2.27) [nie alpha, ia64, riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha, ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  Biblioteka C do parsowania XML-a - biblioteka uruchomieniowa

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Pakiet niedostępny

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [alpha, sh4, sparc64]

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [ia64]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie tandem-mass

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1:201702011-1	216,6 KiB	745,0 KiB	[lista plików]
amd64	1:201702011-1+b1	220,0 KiB	641,0 KiB	[lista plików]
arm64	1:201702011-1	191,3 KiB	564,0 KiB	[lista plików]
armel	1:201702011-1	182,0 KiB	539,0 KiB	[lista plików]
armhf	1:201702011-1	187,8 KiB	387,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1:201702011-1	226,4 KiB	642,0 KiB	[lista plików]
i386	1:201702011-1	235,7 KiB	679,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1:201702011-1	290,8 KiB	1 314,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1:201702011-1	180,9 KiB	574,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1:201702011-1	203,9 KiB	790,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1:201702011-1	221,1 KiB	794,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1:201702011-1	228,1 KiB	792,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1:201702011-1+b1	198,7 KiB	460,0 KiB	[lista plików]
s390x	1:201702011-1	187,3 KiB	636,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1:201702011-1	240,0 KiB	550,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1:201702011-1	181,0 KiB	604,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1:201702011-1	207,9 KiB	583,0 KiB	[lista plików]