Pakiet: stacks (2.66+dfsg-1 i inne)
Odnośniki dla stacks
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego stacks:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Tim Booth (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [creskolab.uoregon.edu]
Podobne pakiety:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Inne pakiety związane z stacks
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- Dodatkowe narzędzia z 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libdbi-perl
- Interfejs bazodanowy Perl (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
również pakiet wirtualny udostępniany przez r-cran-littler
-
- sug: gdb
- GNU Debugger
również pakiet wirtualny udostępniany przez gdb-minimal
Pobieranie stacks
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 065,5 KiB | 6 519,0 KiB | [lista plików] |
amd64 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 154,6 KiB | 5 807,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 004,8 KiB | 5 725,0 KiB | [lista plików] |
armel | 2.66+dfsg-1+b1 | 979,6 KiB | 5 148,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 000,0 KiB | 3 632,0 KiB | [lista plików] |
hppa (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 046,7 KiB | 5 345,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 233,2 KiB | 6 100,0 KiB | [lista plików] |
ia64 (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 286,9 KiB | 11 193,0 KiB | [lista plików] |
m68k (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 087,6 KiB | 5 632,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 062,3 KiB | 7 443,0 KiB | [lista plików] |
ppc64 (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 112,8 KiB | 7 455,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 123,6 KiB | 7 005,0 KiB | [lista plików] |
riscv64 | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 103,0 KiB | 4 329,0 KiB | [lista plików] |
s390x | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 104,7 KiB | 6 049,0 KiB | [lista plików] |
sh4 (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 278,3 KiB | 5 648,0 KiB | [lista plików] |
sparc64 (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 918,0 KiB | 11 538,0 KiB | [lista plików] |
x32 (port nieoficjalny) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1 158,9 KiB | 5 473,0 KiB | [lista plików] |