Pakiet: sibsim4 (0.20-5 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::TODO, use::comparing, Wyszukiwanie, Obsługa formatu: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

Pobieranie sibsim4

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.20-5	30,9 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.20-5	29,7 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.20-5	28,1 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
armel	0.20-5	27,5 KiB	72,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.20-5	26,2 KiB	56,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.20-5	28,8 KiB	69,0 KiB	[lista plików]
i386	0.20-5	30,8 KiB	80,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.20-5	36,3 KiB	112,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.20-5	25,6 KiB	60,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.20-5	29,3 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.20-5	31,9 KiB	150,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.20-5	31,9 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.20-5+b1	30,7 KiB	65,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.20-5	30,5 KiB	77,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.20-5	29,5 KiB	60,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.20-5	27,7 KiB	78,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.20-5	28,5 KiB	72,0 KiB	[lista plików]