Pakiet: provean (1.1.5+ds-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Inne pakiety związane z provean

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie provean

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	51,0 KiB	161,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.1.5+ds-2	48,1 KiB	141,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1.5+ds-2	44,7 KiB	125,0 KiB	[lista plików]
armel	1.1.5+ds-2	45,4 KiB	132,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.1.5+ds-2	47,1 KiB	108,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	50,9 KiB	137,0 KiB	[lista plików]
i386	1.1.5+ds-2	51,0 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	61,8 KiB	228,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	41,5 KiB	128,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1.5+ds-2	49,9 KiB	166,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	48,5 KiB	219,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1.5+ds-2	48,8 KiB	153,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1.5+ds-2+b1	50,9 KiB	122,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.1.5+ds-2	44,1 KiB	137,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	50,0 KiB	120,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	41,5 KiB	131,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.1.5+ds-2	46,4 KiB	128,0 KiB	[lista plików]