Pakiet: probcons (1.12-14 i inne)

[ Pakiet źródłowy: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie probcons

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.12-14	142,6 KiB	418,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.12-14	116,4 KiB	377,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.12-14	109,1 KiB	328,0 KiB	[lista plików]
armel	1.12-14	105,1 KiB	347,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.12-14	103,2 KiB	255,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.12-14	128,9 KiB	366,0 KiB	[lista plików]
i386	1.12-14	102,4 KiB	367,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.12-14	191,0 KiB	741,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.12-14	96,7 KiB	367,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.12-14	129,1 KiB	410,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.12-14	134,5 KiB	481,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.12-14	136,2 KiB	417,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.12-14+b1	131,1 KiB	303,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.12-14	99,7 KiB	376,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.12-14	131,4 KiB	312,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.12-14	117,5 KiB	374,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.12-14	122,0 KiB	371,0 KiB	[lista plików]