Pakiet: murasaki (1.68.6-13 i inne)

[ Pakiet źródłowy: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

  dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64, x32]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

  Biblioteka Boost.Iostreams

  dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64, x32]

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu67 [sparc64]

  Pakiet niedostępny

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-regex1.74.0

• dep: libboost-system1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcrypto++6 [sparc64]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie sparc64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

• rec: murasaki-examples

  Pakiet niedostępny

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	586,0 KiB	4 914,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.68.6-13+b5	611,1 KiB	4 244,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.6-13+b5	533,9 KiB	4 319,0 KiB	[lista plików]
armel	1.68.6-13+b5	444,2 KiB	3 315,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.68.6-13+b5	457,2 KiB	2 339,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	585,9 KiB	4 020,0 KiB	[lista plików]
i386	1.68.6-13+b5	621,8 KiB	4 071,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	658,9 KiB	8 435,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	487,8 KiB	3 599,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.6-13+b5	578,5 KiB	5 874,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	597,0 KiB	5 792,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.6-13+b4	599,9 KiB	5 536,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.68.6-13+b3	572,8 KiB	3 211,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.6-13+b4	596,5 KiB	4 799,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b4	505,8 KiB	3 596,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.68.6-11	413,1 KiB	3 088,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	481,2 KiB	2 773,0 KiB	[lista plików]