Pakiet: lighter (1.1.2-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Inne pakiety związane z lighter

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie lighter

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.1.2-7	49,9 KiB	180,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.1.2-7	46,2 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1.2-7	44,1 KiB	116,0 KiB	[lista plików]
armel	1.1.2-7	44,0 KiB	179,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.1.2-7	44,1 KiB	115,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.1.2-7	53,3 KiB	128,0 KiB	[lista plików]
i386	1.1.2-7	51,1 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.1.2-7	56,1 KiB	185,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.1.2-7	47,7 KiB	131,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1.2-7	48,8 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.1.2-7	49,2 KiB	180,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1.2-7	49,7 KiB	180,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1.2-7+b1	48,2 KiB	109,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.1.2-7	45,8 KiB	128,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.1.2-7	57,9 KiB	179,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.1.2-7	47,9 KiB	1 078,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.1.2-7	45,5 KiB	115,0 KiB	[lista plików]