Pakiet: kma (1.4.14-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kma  ]

mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases

KMA is mapping a method designed to map raw reads directly against redundant databases, in an ultra-fast manner using seed and extend. KMA is particularly good at aligning high quality reads against highly redundant databases, where unique matches often does not exist. It works for long low quality reads as well, such as those from Nanopore. Non- unique matches are resolved using the "ConClave" sorting scheme, and a consensus sequence are outputtet in addition to other common attributes.

Inne pakiety związane z kma

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie kma

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.4.14-2	212,3 KiB	799,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.4.14-2	211,9 KiB	572,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.4.14-2	197,5 KiB	668,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.3.23-1	136,9 KiB	355,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.4.14-2	258,7 KiB	1 177,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.23-1	121,6 KiB	328,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.4.14-2	203,7 KiB	760,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.4.14-2	223,3 KiB	860,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.4.14-2	227,1 KiB	796,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.4.14-2+b1	226,5 KiB	497,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.4.14-2	231,6 KiB	672,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.23-1	166,7 KiB	321,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.4.14-2	187,3 KiB	3 106,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.4.14-2	167,5 KiB	425,0 KiB	[lista plików]