Pakiet: gsort (0.1.4-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Inne pakiety związane z gsort

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

Pobieranie gsort

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.1.4-3+b9	168,2 KiB	806,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.1.4-3+b15	1 870,6 KiB	5 421,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.1.4-3+b15	1 612,4 KiB	5 141,0 KiB	[lista plików]
armel	0.1.4-3+b15	1 598,9 KiB	5 308,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.1.4-3+b15	1 592,2 KiB	5 280,0 KiB	[lista plików]
i386	0.1.4-3+b15	1 739,2 KiB	5 344,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.1.4-3+b15	1 460,8 KiB	5 992,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.1.4-3+b10	195,7 KiB	1 123,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.1.4-3+b15	1 606,3 KiB	5 332,0 KiB	[lista plików]
riscv64 (port nieoficjalny)	0.1.4-3+b9	1 551,6 KiB	5 008,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.1.4-3+b15	1 710,6 KiB	5 697,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.1.4-3+b8	165,5 KiB	1 257,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.1.4-3+b10	175,1 KiB	703,0 KiB	[lista plików]