Pakiet: ataqv (1.3.1+ds-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ataqv  ]

Kontrola jakości i wizualizacja ATAC-seq

Zestaw narzędzi do mierzenia i porównywania wyników ATAC-seq, stworzony w laboratorium Parkera na Uniwersytecie Michigan. Został on napisany, aby pomóc zrozumieć, jak dobrze działały testy ATAC-seq, i aby ułatwić wykrywanie różnic, które mogą być spowodowane przygotowaniem biblioteki lub sekwencjonowaniem.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: Ncurses (terminalowy)

Inne pakiety związane z ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  iconic font designed for use with Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

  dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [nie hppa, x32]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

  dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nie hppa, x32]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Biblioteka Boost.Iostreams

  dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie hppa, x32]

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.32) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10) [hppa]

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nie hppa]

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha, hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240127-1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Modern alternative to CSS resets

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: wget

  Narzędzie pobierające pliki z Internetu

Pobieranie ataqv

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b3	3 279,1 KiB	6 729,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.1+ds-2+b2	3 320,5 KiB	6 526,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.1+ds-2+b2	3 254,3 KiB	6 466,0 KiB	[lista plików]
armel	1.3.1+ds-2+b2	3 238,7 KiB	6 232,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.3.1+ds-2+b2	3 246,5 KiB	5 848,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.3.0+ds-1	3 327,2 KiB	6 725,0 KiB	[lista plików]
i386	1.3.1+ds-2+b2	3 357,6 KiB	6 603,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b2	3 358,7 KiB	8 035,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b3	3 304,0 KiB	6 487,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.1+ds-2+b2	3 249,9 KiB	6 868,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.1+ds-2+b2	3 296,8 KiB	6 723,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.1+ds-2+b2	3 311,8 KiB	6 207,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b3	3 377,5 KiB	6 467,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b2	3 327,5 KiB	6 428,0 KiB	[lista plików]