Pakiet: altree (1.3.2-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: altree  ]

Program do wykonywania analiz dotyczących związku i miejsca na podstawie filogenezy

ALTree został zaprojektowany do wykrywania związku oraz wyszukiwania miejsc podatnych na zakażenie przy użyciu drzew filogenetycznych haplotypu: po pierwsze, umożliwia wykrycie związku pomiędzy genem kandydującym a chorobą, i po drugie, pozwala na postawienie hipotezy na temat podatności loci.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Perl, Biblioteki, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Rola: Biblioteka deweloperska, role::program, role::shared-lib, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, works-with-format::TODO, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z altree

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libmath-tamuanova-perl

  Perl extension for the tamuanova library

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [nie armhf]

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]

• dep: perlapi-5.38.2 [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  lub libblis4

  BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

  lub libmkl-rt

  Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• sug: altree-examples

  Przykładowe pliki do ALTree

Pobieranie altree

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	337,1 KiB	570,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.2-2+b2	337,1 KiB	562,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.2-2+b2	337,2 KiB	570,0 KiB	[lista plików]
armel	1.3.2-2+b2	336,3 KiB	561,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.3.2-2+b2	333,2 KiB	541,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	338,4 KiB	573,0 KiB	[lista plików]
i386	1.3.2-2+b2	337,1 KiB	561,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	345,3 KiB	621,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	333,0 KiB	553,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.2-2+b2	336,8 KiB	573,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	340,1 KiB	635,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.2-2+b2	339,4 KiB	634,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.2-2+b3	338,6 KiB	554,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.3.2-2+b2	337,4 KiB	566,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	338,3 KiB	569,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	334,2 KiB	1 532,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.3.2-2+b2	336,5 KiB	557,0 KiB	[lista plików]