wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: alien-hunter  ]

Pakiet: alien-hunter (1.7-10)

Odnośniki dla alien-hunter

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego alien-hunter:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Interpolated Variable Order Motifs to identify horizontally acquired DNA

Alien_hunter is an application for the prediction of putative Horizontal Gene Transfer (HGT) events with the implementation of Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). An IVOM approach exploits compositional biases using variable order motif distributions and captures more reliably the local composition of a sequence compared to fixed-order methods. Optionally the predictions can be parsed into a 2-state 2nd order Hidden Markov Model (HMM), in a change-point detection framework, to optimize the localization of the boundaries of the predicted regions. The predictions (embl format) can be automatically loaded into Artemis genome viewer freely available at: http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Biologia strukturalna, Zaimplementowane w: implemented-in::java, implemented-in::perl, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, scope::utility, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z alien-hunter

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie alien-hunter

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 27,8 KiB113,0 KiB [lista plików]