Pakiet: python3-pairtools-examples (1.0.3-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: pairtools  ]

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Inne pakiety związane z python3-pairtools-examples

• enh: python3-pairtools

  Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Pobieranie python3-pairtools-examples

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.3.0-3.2+b2	12,1 KiB	50,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.3.0-3.2+b1	12,1 KiB	50,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.3.0-3.2+b2	12,1 KiB	50,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.3-1	790,0 KiB	843,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.3-1+b1	790,3 KiB	844,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.3.0-3.2+b2	12,1 KiB	50,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.3.0-3.2+b1	12,1 KiB	50,0 KiB	[lista plików]