Pakiet: python3-mdanalysis (2.9.0-12 i inne)

[ Pakiet źródłowy: mdanalysis  ]

analyse molecular dynamics files and trajectories

MDAnalysis is a Python library for the analysis of computer simulations of many-body systems at the molecular scale, spanning use cases from interactions of drugs with proteins to novel materials. It is widely used in the scientific community and is written by scientists for scientists.

MDAnalysis allows one to read particle-based trajectories (including individual coordinate frames such as biomolecules in the PDB format) and access the atomic coordinates through NumPy arrays. This provides a flexible and relatively fast framework for complex analysis tasks. In addition, powerful atom selection commands are implemented. Trajectories can also be manipulated (for instance, fit to a reference structure) and written out.

It works with a wide range of popular simulation packages including Gromacs, Amber, NAMD, CHARMM, DL_Poly, HooMD, LAMMPS and many others — see the lists of supported trajectory formats and topology formats. MDAnalysis also includes widely used analysis algorithms in the MDAnalysis.analysis module.

The MDAnalysis project uses an open governance model and is fiscally sponsored by NumFOCUS.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-mdanalysis

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, hppa, m68k]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.14) [nie alpha]

  dep: python3 (>= 3.12~) [alpha, m68k, sh4]

  dep: python3 (>= 3.13~) [nie alpha, m68k, sh4]

• dep: python3-biopython (>= 1.80) [nie alpha, hppa, loong64, m68k, ppc64, sh4]

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-duecredit

  Publications (and donations) tracer

• dep: python3-fasteners [alpha, m68k, sh4]

  provides useful locks - Python 3.x

• dep: python3-filelock [nie alpha, m68k, sh4]

  platform independent file locking module

• dep: python3-griddataformats

  Handling volumetric data in Python

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• dep: python3-mda-xdrlib

  Stand-alone XDRLIB module (from cpython 3.10.8)

• dep: python3-mmtf

  binary encoding of biological structures (Python 3)

• dep: python3-numpy [nie alpha, m68k, sh4]

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, m68k, sh4]

• dep: python3-numpy-abi9 [alpha, m68k, sh4]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [nie alpha, m68k, sh4]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

  lub python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-threadpoolctl

  Python helpers for common threading libraries (BLAS, OpenMP)

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• sug: python-mdanalysis-doc

  analyse molecular dynamics files and trajectories ( documentation)

Pobieranie python3-mdanalysis

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.7.0-5	1 907,4 KiB	22 469,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.9.0-12	4 104,7 KiB	24 691,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.9.0-12	4 050,5 KiB	24 595,0 KiB	[lista plików]
armel	2.9.0-12	4 002,7 KiB	24 549,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.9.0-12	3 969,4 KiB	23 653,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.9.0-12	4 170,0 KiB	24 911,0 KiB	[lista plików]
i386	2.9.0-12	4 071,3 KiB	24 667,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.9.0-12	4 141,0 KiB	24 978,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.7.0-5	2 096,9 KiB	24 641,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.9.0-12	4 070,4 KiB	25 132,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.9.0-12	4 127,3 KiB	25 649,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.9.0-12	4 146,7 KiB	25 235,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.9.0-12	4 196,8 KiB	23 883,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.9.0-12	3 922,6 KiB	24 479,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.7.0-5+b1	2 594,0 KiB	24 688,0 KiB	[lista plików]