Pakiet: python3-unifrac (1.3-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Inne pakiety związane z python3-unifrac

• dep: cython3 [alpha, m68k]

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libssu0 (>= 0.10.0) [alpha]

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

  dep: libssu0 (>= 1.1.1) [m68k]

  dep: libssu0 (>= 1.4) [nie alpha, m68k]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.11) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.12) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.13) [nie alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.10~) [alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.11~) [nie alpha, m68k]

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0) [nie alpha, m68k]

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial [alpha, m68k]

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-iow [nie alpha]

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy [alpha, m68k]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [nie alpha, m68k]

• dep: python3-numpy-abi9 [nie alpha, m68k]

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-skbio [alpha, m68k]

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

  dep: python3-skbio (>= 0.5.8-3~) [nie alpha, m68k]

Pobieranie python3-unifrac

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.10.0-3	106,4 KiB	582,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3-2	182,3 KiB	895,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3-2	161,3 KiB	975,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.1.1-2	135,9 KiB	715,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3-2	152,2 KiB	987,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3-2	182,0 KiB	1 039,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3-2	183,3 KiB	807,0 KiB	[lista plików]