Pakiet: libbio-samtools-perl (1.43-5 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Perl, Biblioteki, Zaimplementowane w: implemented-in::c, implemented-in::perl, Rola: Biblioteka deweloperska, Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.15) [sparc64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: perl (>= 5.22.1-7) [sparc64]

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [nie armhf, sparc64]

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]

• dep: perlapi-5.22.1 [sparc64]

  Pakiet niedostępny

• dep: perlapi-5.38.2 [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie libbio-samtools-perl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.43-5	181,9 KiB	745,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.43-5	177,0 KiB	586,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.43-5	166,2 KiB	614,0 KiB	[lista plików]
armel	1.43-5	162,2 KiB	548,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.43-5	161,5 KiB	448,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.43-5	177,7 KiB	635,0 KiB	[lista plików]
i386	1.43-5	186,7 KiB	620,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.43-5	206,8 KiB	990,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.43-5	163,5 KiB	540,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.43-5	165,0 KiB	698,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.43-5	182,5 KiB	742,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.43-5	184,7 KiB	742,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.43-5	179,5 KiB	530,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.43-5	171,5 KiB	610,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.43-5	181,9 KiB	613,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.43-1	174,3 KiB	616,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.43-5	177,4 KiB	568,0 KiB	[lista plików]