wszystkie opcje
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: parsnp  ]

Pakiet: parsnp (1.5.4+dfsg-1)

Odnośniki dla parsnp

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego parsnp:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

rapid core genome multi-alignment

Parsnp was designed to align the core genome of hundreds to thousands of bacterial genomes within a few minutes to few hours. Input can be both draft assemblies and finished genomes, and output includes variant (SNP) calls, core genome phylogeny and multi-alignments. Parsnp leverages contextual information provided by multi-alignments surrounding SNP sites for filtration/cleaning, in addition to existing tools for recombination detection/filtration and phylogenetic reconstruction.

Inne pakiety związane z parsnp

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie parsnp

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 204,8 KiB1 938,0 KiB [lista plików]
amd64 185,2 KiB1 881,0 KiB [lista plików]
arm64 174,9 KiB1 837,0 KiB [lista plików]
armel 167,3 KiB1 836,0 KiB [lista plików]
armhf 164,4 KiB1 760,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 187,7 KiB1 862,0 KiB [lista plików]
i386 188,3 KiB1 900,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 177,0 KiB1 880,0 KiB [lista plików]
mips64el 185,0 KiB1 927,0 KiB [lista plików]
mipsel 187,4 KiB1 925,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 194,7 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
ppc64el 197,4 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
riscv64 (port nieoficjalny) 200,4 KiB1 822,0 KiB [lista plików]
s390x 169,9 KiB1 885,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 210,8 KiB1 841,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 168,9 KiB1 869,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 187,3 KiB1 864,0 KiB [lista plików]