wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: parsnp  ]

Pakiet: parsnp (2.0.4+dfsg-1)

Odnośniki dla parsnp

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego parsnp:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

rapid core genome multi-alignment

Parsnp was designed to align the core genome of hundreds to thousands of bacterial genomes within a few minutes to few hours. Input can be both draft assemblies and finished genomes, and output includes variant (SNP) calls, core genome phylogeny and multi-alignments. Parsnp leverages contextual information provided by multi-alignments surrounding SNP sites for filtration/cleaning, in addition to existing tools for recombination detection/filtration and phylogenetic reconstruction.

Inne pakiety związane z parsnp

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie parsnp

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 204,0 KiB2 010,0 KiB [lista plików]
amd64 199,9 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
arm64 189,9 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
armel 185,5 KiB1 904,0 KiB [lista plików]
armhf 181,7 KiB1 824,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 199,2 KiB1 914,0 KiB [lista plików]
i386 198,6 KiB1 940,0 KiB [lista plików]
ia64 (port nieoficjalny) 255,7 KiB2 244,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 189,5 KiB1 928,0 KiB [lista plików]
mips64el 201,4 KiB2 020,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 207,6 KiB2 009,0 KiB [lista plików]
ppc64el 210,6 KiB2 009,0 KiB [lista plików]
riscv64 217,7 KiB1 881,0 KiB [lista plików]
s390x 182,4 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 226,1 KiB1 945,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 181,6 KiB2 653,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 201,6 KiB1 928,0 KiB [lista plików]